满清权贵，汉人当家作主”，也十分符合这些身为汉族人的清军降兵的人心，毕竟他们当清军的时候也饱受满人军官的欺压。经过甄别和筛选，喜欢抽大烟且曾经前科累累的都被淘汰，投诚的一万多清军中共有五千多青壮年被编入汉军。出击的汉军分为四路军，分别朝着川北、川东（包括重庆市）、川南、川中方向四面出击，犹如一张不断膨胀的蜘蛛网，将汉军的势力范围扩张向整个四川盆地，乃至覆盖整个四川省。
整编后的汉军主要编制如下：
禁卫团团长段江涛副团长樊昌昊
第一师师长龙兴汉副师长余栋臣（原义军首领）
第1团团长张仲伟第2团团长罗文榜（原义军首领）第3团团长曾阿义（原义军首领）
第二师师长董存祥副师长赵昌勖（原义军首领）
第4团团长罗显文第5团团长彭皓亮第6团团长李冈中（原义军首领）
第三师师长黄永光副师长何明阳
第7团团长刘佳恒第8团团长赵佳祎第9团团长余尔玛（原清军正八品千总卫，羌族）
第四师师长华震东副师长罗盛育
第10团团长赵海军第11团团长尹润海第12团团长李喜浩
第五师师长吴俊垒副师长杨家根
第13团团长董彦杰第14团团长温兴茂第15团团长曲吉东
第六师师长吴炳文（原清军重庆镇总兵，历史上在甲午战争中率领清军乘坐“高升”号运兵舰支援朝鲜时被日军“浪速”号军舰击沉，继而阵亡）副师长刘峰岭
第16团团长刘峰岭（兼任）第17团团长张泾汇（原清军从七品游牧副尉）第18团团长洛桑德吉（原清军正九品兰翎长，藏族）
其中，第一师和第二师作为东路军，朝着川东方向进发，目标是占领重庆，扼守夔门关，保护四川的东大门万无一失；第三师和第四师作为北路军，朝着川北汉水谷地和汉中地区进发，目标是占领剑门关八百里蜀道，确保四川的北大门高枕无忧；第五师作为南路军，朝着川南攀枝花地区进发，目标是抵御云贵地区的清军进犯四川；第六师作为西路军，朝着大渡河和邛崃山（四川盆地和青藏高原的分界线）出发，沿着大……
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